Programme : 

Lundi 25 novembre

10h00-10h15 : Accueil des participants

10h15-10h30 : Introduction de la plénière – objectifs d’E3GP3 – analyse biblio – évolutions du réseau et de la composition du CS.
Elisabeth Fournier

Session 1 : Epidémiologie et génétique des populations

10h30–10h50 : The population structure of the barley Pathogen Pyrenophora teres is linked to its host vernalization requirements.
Julie Ramirez

10h50–11h10 : Transmission des épidémies dans les paysages agricoles : pourrait-on la limiter par le positionnement des cultures ?
Lydia Bousset

11h10–11h30 : Relation entre la résistance à la sécheresse de l’hôte et sa sensibilité à l’agent pathogène Diplodia sapinea.
Mireia Gomez-Gallego

11h30-11h50 : Diversity of rice blast (Pyricularia oryzae) in the Yuanyang terraces.
Pierre-Michel Marty

11h50-12h10 : New insights on population genetics of partiality clonal organisms.
Ammar Abdalrahem

12h10-12h30 : Le clone infectieux comme outil pour l'étude de l'interaction tripartite riz/ Polymyxa graminis/ RSNV.
Emma-Louise Jaffre

12h30-14h00 : Pause repas

Session 2 : Adaptation et génomique des populations

14h00-14h20 : Investigating the host adaptation of Venturia inaequalis.
Sirine Benmamar

14h20-14h40 : Use of virulent Globodera pallida lines derived from experimental evolution to reveal candidate regions for the adaptation of resistant potatoes.
Océane Lechevalier

14h40-15h00 : Evolution of phenotypic plasticity in the fungal pathogen Zymoseptoria tritici.
Anne Genissel

15h00-15h20 : Gestion du CMV à Espelette : Bilan de missions pimentées.
Loup Rimbaud

15h20–15h40 : Comparative genomics of Xylella fastidiosa subsp. multiplex strains from France: Genetic diversity and pathogen dynamics.
Jessica Dittmer

15h40–16h00 : Inférer le cout de la virulence à partir de données populationnelles, est-ce possible ?
Fabien Halkett

16h00-16h30 : Pause-café

Session 3 : Zoom sur trois projets SPE-Num

16h30-16h35 : Introduction SPE-Num

16h35-16h50 : Projet SPE D-P-SCH : Diagnostic de Pathogènes, par Sequençage, au CHamp.
Jérôme Gouzy

16h50-17h05 : Projet GraPanPhy : Utilisation de Graphes de Pangénome pour l’analyse et le suivi de populations d’agents Phytopathogènes.
Nicolas Lapalu

17h05-17h20 : Projet FUNSEQ : Développement d’une approche PenSeq (pathogen enrichment sequencing) pour le monitoring des populations du champignon phytopathogène Fusarium graminearum à partir d’ADN environnemental.
Marie Foulongne-Oriol

17h20-17h40 : Discussion générale autour de SPE-Num (toutes les questions de cette session lors de cette discussion générale)

mardi 26 novembre

9h00–9h15 : Accueil des participants

Session soutiens aux déplacements

9h15-9h25 : Chloé Feltin
9h25-9h35 : Emma-Louise Jaffre
9h35-9h45 : Ammar Abdalrahem
9h45-9h55 : Sirine Benmamar

Session thématique : Microbiote et santé des plantes

9h55-10h50 : The Root Microbiota: Disassembling and Rebuilding to Explore Plant-Microbe-Microbe Interactions.
Orateur invité : Stéphane Hacquard (Max Planck Institute)

10h50-11h20 : Pause-café

11h20-11h40 : Dynamique du phytomicrobiome au cours du cycle du blé et implications pour le biocontrôle de la fusariose des épis.
Adeline Picot

11h40-12h00 : Le dépérissement du noyer en France, étude du pathobiome pour comprendre l'émergence de ce syndrome.
Flora Pensac

12h00-12h20 : Projet MICROBE : conservation des microbiotes.
Céline Mirguet

12h20-12h40 : Harnessing soil microbiota: optimising hatching stimulation for effective biocontrol of Heterodera carotae.
Marine Biget

12h40-14h10 : Pause repas

14h10-14h30 : Impact du gène de résistance RLM11 sur le microbiote de Brassica napus.
Valérie Laval

14h30-14h50 : Changements du microbiote associé au riz malades au Cambodge : quel héritage pour la croissance et la résistance de la génération suivante ?
Léa Jobert

14h50-15h10 : A new scenario of pathogen-microbiota interactions for the oomycete Plasmopara viticola.
Paola Fournier

15h10-16h00 : Discussion générale